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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

四川首部县级文库《丹棱文库》正式亮相******

四川首部县级文库《丹棱文库》正式亮相丹棱县向四川省图书馆赠送《丹棱文库》。　彭川 摄

　　中新网眉山1月11日电 (刘忠俊 彭川)眉山市丹棱县文学艺术界联合会1月11日透露，该省首个由县级单位编纂的综合性文库《丹棱文库》首批20册正式亮相。

　　自古以来，丹棱皆为人文之邦，隋唐以来人才辈出，至两宋达到鼎盛，著名的大史学家李焘是仅次于司马光的史学巨匠，其书写的《续资治通鉴长编》是清代四库馆臣所谓“卓然可传”的三部私修本朝史之一，清代大文学家彭端淑所著《为学》，浸润、滋养了无数读书人......如何整理好、保护好、传承好这些文化遗产，成为一项重大课题。2021年，丹棱县与四川大学合作，启动了《丹棱文库》编纂出版工作。

　　丹棱县文学艺术界联合会表示，《丹棱文库》编纂借鉴了前代所编郡邑丛书及当代各省所编的地方文库，并结合地方文化特殊性，对丹棱地区自唐五代以迄民国初年的汉文文献进行了系统调查、汇集和整理，以作者生卒年代为序，采用影印方式出版。文库共收纳了丹棱名人和丹棱本土传世作品44种书目、150册、3230万字。“作为四川县级地方文献，集中收集展示了历史人文、学术、风俗等文献资料，创造了一个首例，对传承发展中华优秀传统文化上，具有一定标杆价值。”四川大学中华文化研究院执行院长、古籍整理研究所所长舒大刚教授点评称。

首批《丹棱文库》正式亮相。　彭川 摄首批《丹棱文库》正式亮相。　彭川 摄

　　丹棱县文化广播电视和旅游局相关负责人表示，下一步将重点加强《丹棱文库》阐释、发掘、赏析，开发不同版本本土教材及宣传资料，借助文字、图像、声音等多种现代化表达形式，实现简单易懂、雅俗共赏。同时，将以时间为轴，理清地方文化坐标，图文并茂阐释精神文化内涵，让地方文化真正看得见摸得着。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）